Huyện được thành lập năm 1994 thông qua việc hợp nhất các huyện cũ Eisenach và Bad Salzungen, và vài đô thị từ huyện Bad Langensalza. Thành phố Eisenach đã được tách khỏi huyện này năm 1998.

Huyện được đặt tên theo lâu đài Wartburg, một tòa lâu đài gần Eisenach là nơi trú ngụ của Martin Luther năm 1521.